نیمسال اول — جمع ۸ واحد
| ردیف | شماره درس | عنوان درس | واحد | نوع درس | پیشنیاز / همنیاز |
| ۱ | 890001 | ژنتیک پروکاریوتها | ۲ | الزامی | — |
| ۲ | 890002 | ردهبندی میکروارگانیسمها | ۲ | الزامی | — |
| ۳ | 890000 | فیزیولوژی میکروارگانیسم | ۲ | الزامی | — |
| ۴ | 890006 | متون تخصصی میکروبیولوژی | ۲ | اختیاری | — |
| جمع واحد: ۸ |
نیمسال دوم — جمع ۱۰ واحد
| ردیف | شماره درس | عنوان درس | واحد | نوع درس | پیشنیاز / همنیاز |
| ۱ | 890011 | میکروبیولوژی خاک | ۲ | اختیاری | — |
| ۲ | 890003 | بیوانفورماتیک | ۲ | الزامی | — |
| ۳ | 890005 | روشها در میکروبیولوژی | ۲ | الزامی | — |
| ۴ | 890004 | بومشناسی میکروارگانیسم | ۲ | الزامی | — |
| ۵ | 890013 | میکروبیولوژی آب و پساب | ۲ | اختیاری | — |
| جمع واحد: ۱۰ |
نیمسال سوم — جمع ۸ واحد
| ردیف | شماره درس | عنوان درس | واحد | نوع درس | پیشنیاز / همنیاز |
| ۱ | 890019 | ایمنی سلامت و محیط زیست | ۲ | اختیاری | — |
| ۲ | 890007 | آمار با نگرش زیستی | ۲ | اختیاری | — |
| ۳ | 890014 | میکروبیولوژی مدیریت پسماند | ۲ | اختیاری | — |
| ۴ | 890021 | سمینار | ۲ | اختیاری | — |
| جمع واحد: ۸ |
نیمسال چهارم — جمع ۶ واحد
| ردیف | شماره درس | عنوان درس | واحد | نوع درس | پیشنیاز / همنیاز |
| ۱ | 890008 | پایاننامه | ۶ | الزامی | — |
| جمع واحد: ۶ |
جمعاً ۳۲ واحد — کارشناسی ارشد میکروبیولوژی (گرایش محیطی)